A Honvédelmi Minisztérium előzetesen jól felkészült az árvíz elleni védekezésben való részvételre. A HM-ben és a középszintű vezetési szerveknél 03.31.-én megalakították a Katasztrófavédelmi Operatív Bizottságot (KOB) és a különböző parancsnokságok Katasztrófavédelmi Operatív Csoportjait (KOCS), amelyek 24 órás, folyamatos szolgálati rendben koordinálják a védekezésbe bevont árvízi munkacsoportok működését és – amennyiben az szükségessé válik – további alakulatok készenlétbe helyezését.
A Honvédelmi Katasztrófavédelmi Rendszer alkalmazható munkacsoportjai továbbra is II. fokú készenléti fokozatban (4 órás indulási készenlét) vannak.2006. 03.30.-án érkezett az első igénybejelentés katonai erők védekezésben való részvételére. A tárca 2006. 03.31-én reggel kapcsolódott be a védekezésbe 150 fővel a MH Szentendrei Kiképző Központ valamint a Szakképző Iskoláról, akik 31-én nappal és egész éjjel folytatták a védmü megerősítését. Jelenleg 1db MI-8 közepes szállító helikopter Szentendrén, 1db MI-17 helikopter Tatán, és 2-2db PTSZ-M lánctalpas úszó (kétéltü) harcjármü áll készenlétben Győrben és Szentendrén élet- és vagyonmentésre, amennyiben az szükségessé válna. A helikopterek egy felszállással 25 főt képesek szállítani, míg a kétéltü szállítójármüvek teherbírása 50 fő.
A Magyar Honvédség erői fő árvízvédelmi feladataiHomokzsákok töltése és védőgátak
Nyúlgátak és ideiglenes védmüvek kiépítéseVédmü figyelés, buzgárok, átfolyások elnyomása
Helikopteres személyi mentés és gátmegerősítésÚszó lánctalpas kétéltü biztosítása személy- és vagyonmentéshez
Logisztikai és biztosítási feladatok ellátásaBeavatkozó és mentő készenlét fenntartása
JárőrözésRésztvevő alakulatok:
MH 1. Honvéd Tüzszerész és Hadihajós Ezred, Budapest
MH 11. Hunyadi Mátyás Harckocsi Zászlóalj, TataMH 12. Légvédelmi Rakéta dandár, Győr
MH 25. Klapka György Könnyü Lövész dandár, TataMH 32. Budapest Őr- és Díszezred, Budapest
MH 37. II. Rákóczi Ferenc Müszaki Dandár, SzentesMH 43. Vezetéstámogató Zászlóalj, Székesfehérvár
MH 64. Boconádi Szabó József Logisztikai Ezred, KaposvárMH 86. Szolnok Helikopter Ezred, Szolnok
MH Bakony Harckiképző Központ, VárpalotaMH Központi Honvéd Kórház, Budapest
MH Szentendrei Kiképző Központ, és MH Kinizsi Pál Tiszthelyettes Szakképző Iskola, SzentendreMH Támogató Ezred, Budapest
Zrínyi Miklós Nemzetvédelmi Egyetem, Budapest